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外泌体标准化(外泌体分析)

2023-04-23 03:53:43 作者:max
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劳威尼的外泌体制备方法发明专利有什么现实意义?

这个意义可大了去了,首先你要了解什么是外泌体,以及外泌体的应用范畴,以及最重要的制约着外泌体临床应用的一个主要原因就是外泌体的标准化和量产的问题,这个专利是劳威尼下面的创生芯科提交的。主要内容就是提供了握让仿标准化而且批量制段纤备滑卖外泌体的方法,这对外泌体的实际应用具有非常重要的促进作用。

重磅!非因指南性综述引领液体活检蛋白组技术新风尚!

2022年2月15日,非因生物以第一作者和通讯单位、联合美国纽约圣约翰大学陈哲生教授等在《Molecular Cancer》杂志上( IF:27.401 )发表了题为“Proteomics technologies for cancer liquid biopsies”的综述性文章,回顾了包括RPPA在内的多种高通量蛋白质组学技术在肿瘤液体活检中的研究进展及临床转化应用策略。

本文简要介绍了能够从液体活检样本中同时检测至少数百种蛋白质的高内涵蛋白质组学技术原理(图1),包括:RPPA反相蛋白微阵列技术(非因生物提供)、质谱技术、抗原/抗体阵列技术、基于核酸适配体(Aptamer)的检测技术和邻位延伸技术(PEA),并比较了上述各技术的优劣势(表1,嫌长不看也要看的表),同时介绍了各技术在癌症液体活检研究领域和临床转化方向的应用进展。( 原文链接: )

蛋白组学液态活检生物标志物研究背景

与肿瘤诊断的“金标准”组织活检相比,液体活检可通过最小入侵方式获得检测样本,同时克服异质性,实现动态监测。目前用于液体活检的体液主要为血液和尿液,但理论上,液体活检适用于任何人体内循环或其他人体相关的液体(图2)。作为大多数细胞功能的直接执行者和当前大多数癌症治疗中的直接药物靶标,多重蛋白质组学数据的分析,可能会在癌症进展的所有阶段实时提供更加宝贵的临床相关信息。液体活检样本中的蛋白质组具有巨大复杂性,如蛋白质丰度和翻译后修饰持续且快速的变化,同时蛋白质组技术与高度复杂的测序技术相比仍存在一定局限性,导致蛋白质组学的探究仍然落后于基因组技术,且目前临床转化效率极低,仅通过40多个基于液体活检的蛋白组生物标志物。因此,迫切需要新的蛋白质技术来实现在癌症液体活检中发现生物标志物的目标。

各技术比对

一、 质谱技术(MS)

由于体液样本中蛋白的复杂性,现代质谱技术通过不断优化样本制备方法、开发蛋白定量技术以及改变质谱扫描模式来提高检测精度。质谱法无需假设驱动,可以无偏倚地对样本中的蛋白进行扫描,因此可作为癌症体液样本早期生物标志物发掘的首选方法。目前基于质谱的生物标志物策略主要有:(1)在发现、核实、验证三个阶段,样本数量递增,而检测蛋白范围逐渐缩小的 “三角策略” ;(2)在发现和验证阶段均用“鸟枪法”在大样本队列检测尽可能多的蛋白,平行分析显示共同显著差异的蛋白可作为准生物标志物的 “矩形策略” 。目前基于质谱的液体活检已应用于卵巢癌、泌尿系统癌症、结直肠癌等多种癌症。但如想将质谱应用于广泛的临床试验,还需简化和标准化检测流程、提高检测的通量、精度和鲁棒性,并突破对翻译后修饰蛋白的检测局限性。

二、抗原/抗体阵列技术

抗体阵列 是将特异性抗体固定到带有修饰的平面基质上,通过荧光、化学发光或寡核苷酸标记的方式对样本进行多重靶标(通常为几百种)检测的方式。适用于血清学分析,如肿瘤相关的低丰度分泌蛋白的检测。但受到检测通量、检测动态范围、以及批次效应和信号饱和度、定量精确度的限制,抗体阵列仅可作为基于体液的蛋白组学分析的方法学之一。 抗原阵列 又称功兄槐帆能蛋白阵列,可作为抗原检测平台来检测抗体组成的细微变化,其早羡雹期热点应用是通过血清自身抗体(AAB)来进行生物标志物的研究。最全面的人类抗原阵列覆盖超过81%的蛋白,是血液蛋白全景分析的强有力的工具。但抗原阵列的靶点扩展、可重复性、批次效应和高昂的成本,仍使抗原阵列的应用有所局限。

三、 基于适体的检测

SOMAscan是目前高通量蛋白组检明信测的“新贵”工具,基于能够与不同蛋白质进行紧密结合的慢速率修饰的蛋白质适体(SOMAmer)进行检测。SOMAmer是寡核苷酸配体,结合上可光解的接头或荧光标签,通过构象识别与待测靶标结合,经生物素介导的纯化后,紫外光照射洗脱SOMAmers,并对其进行表征和定量已反应待测样本内的蛋白丰度。该方法具有超高特异性和亲和力,以及较低的批次间差异,目前可平行分析7000+种蛋白质,在结直肠癌和非小细胞肺癌的临床相关的生物标志物筛选中起到关键作用。但与抗体检测相比,现阶段可供研究使用的适体种类有限,尤其是翻译后修饰蛋白为导向的适体开发仍处于初期阶段。同时由于适配体对抗原决定簇的超高亲和力,在蛋白标志物研究的进程中会受到大量信号干扰,影响检测准确度。

四、邻位延伸技术(PEA)

PEA结合了基于抗体的免疫分析(ELISA)和PCR或二代测序(NGS)技术,与质谱检测相比,实现了用更低的样本量检测更广泛的动态范围,高灵敏、高准确、可重复且高保真识别。最先进的PEA检测目前由Olink商业化,可对3072个靶标进行标准测量。PEA首次应用于结直肠癌血液预后标志物的鉴定,后续应用于卵巢癌、前列腺癌等癌种的早期检测、伴随诊断和疾病监测。PEA检测与读取方式(qPCR、NGS)相关,当进行大队列样本分析时,仍需考虑实验误差和批次效应,其次翻译后修饰蛋白的研究对于抗体对开发具有很大瓶颈,对其捕获受到一定限制。

五、反相蛋白微阵列技术(RPPA)

RPPA起源于20年前,是将完全变性的蛋白裂解液固定在特殊载玻片上,通常每种裂解液会进行浓度梯度稀释,接下来用验证好的高度特异性的抗体孵育点样后的载玻片,通过信号放大化学显色或荧光检测捕获定量信息(图3)。RPPA可广泛应用于几百到超过一千个大样本的超稳健平行分析,定量精准,可对500+种细胞表面受体蛋白、细胞信号关键蛋白及蛋白修饰(磷酸化、乙酰化、甲基化等)、蛋白酶类、转录因子等各类代表性靶标进行分门别类的系统深度检测,包括直接和间接的上下游蛋白网络分析。基于以上特征,RPPA广泛应用于癌症基因组图谱项目(TCGA),其公共数据集可在线获取(TCPA,)。RPPA由于其最小的批次差异,可以作为蛋白质生物标志物验证的强大工具,并已成功应用于肺癌的新型生物标志物验证。另外,对外泌体蛋白的检测也成为RPPA在癌症液体活检中的另一项热点应用。 非因生物在国内搭建了基于MD安德森金标准的RPPA分析技术平台,先期完成了一系列工作流程的开发、验证及优化,不断扩展抗体库,并且建立了完备的生信分析体系。帮助国内科研,临床及工作者及广大药物研发相关用户快速高效开展疾病,尤其是肿瘤相关信号通路全景分析、分子机理挖掘、肿瘤相关药理学研究及靶向药物开发。RPPA复杂的技术流程和严格的抗体筛选过程将不再成为国内科研工作者的开展基础和转化医学研究的绊脚石。(点击下方“ 阅读原文 ”,了解详情)

展望

未来,在蛋白质组学技术不断发展的前提下,各技术之间的联合互补应用可以作为可行的、基于肿瘤体液活检的生物标志物正交验证策略(如图4所示)。非因生物依托RPPA技术等各项新型组学技术,将肿瘤精准治疗研究和转化作为核心使命,我们期待着一个更加精简但连贯且标准的蛋白类生物标志物开发流程的出现,并最终应用于癌症转化医学研究。

AI+合成+医疗企业近期动态盘点

「沃时 科技 」致力于搭建AI制药工业平台

以构建制药工业场景AI决策平台为目标的「沃时 科技 」,近日宣布完成千万元天使轮融资,投资方为线性资本,由前一轮股东继续追加投资。

沃时 科技 表示,下一步目标是搭建AI自动化合成平台,结合利用硬件集成与软件的精细控制,实现在合成自动化领域的突破,进而赋能研发人员使其在更具创造性的领域发挥优势。目前已经与客户洽谈合作,预计明年就会推出原型机。

「Deep Genomics」完成1.8亿美元的C轮融资

近日,AI 驱动的RNA疗法开发公司Deep Genomics宣布完成1.8亿美元的C轮融资。所获资金将用于推动Deep Genomics AI平台的建设和RNA疗法管线的开发。

Deep Genomics已经构建了一套称为AI Workbench的系统,该系统已经对整个人类基因组、数百万种遗传变异和数亿种新化合物进行了数十亿次预测。目前AI Workbench已迭代到孝衫唯3.0版本,支持更常见的复杂疾病的靶点识别和药物发现,疾病领域覆盖神经发育、神经退行性和代谢疾病。

「T-knife」:让TCR-T细胞疗法走向临床

近日,过继性T细胞治疗公司T-knife Therapeutics筹集了1.1亿美元的B轮融资,用于开发下一代完全个性化的新生抗原T细胞受体(TCR)疗法。

T-knife公司通过共同创始人Thomas Blankenstein教授的开拓性工作建立了其携带整个人类TCRαβ基因位点的专有HuTCR转基因小鼠平台,该小鼠平台仅表达限于人类HLA的人类TCR。同时相关研究还表明,用人类肿瘤抗原免疫HuTCR小鼠鉴定具有优化亲和力/特异性特征的TCR的CD4+和CD8+T细胞,能够显著提升细胞的抗肿瘤活性。T-knife在随后的工作中通过有效的基因启动和TCR选择建立了非常多样化的TCR库。并利用这种天然的高亲和力TCR选择平台为临床开发开发了一系列获得专利的独特TCR候选药物。

「中慧元通」获超6亿元Pre-IPO轮融资

中慧元通获超6亿元Pre-IPO轮融资,投资方有盈科资本、弘晖资本、国海创新资本、松禾资本等。

中慧元通是一家从事疫苗研发、注册申报、产业化和销售的专业公司。目前该公司已取得儿童型四价流感病毒亚单位疫苗、成人型四价流感病毒亚单位疫苗、重组带状疱疹疫苗、九价重组人乳头瘤病毒疫苗4个一类新药临床批件、23价肺炎球菌多糖疫苗1个九类新药临床批件。

「金迪克生物」在上海证券交易所科创板上市

8月2日,金迪克生物正式在上海证券交易所科创板上市。根据金迪克生物招股说明书,该公司本次IPO的保荐机构为中信证券,发行价格为55.18元/股,募集资金总额约16亿元人民币。金迪克生物成立于2008年,一直以来专注于人用疫苗研发、生产、销售。

「博动医学」专注血管介入诊疗

博动医学影像 科技 (上海)有限公司(博动医学)宣布完成超亿美元C轮融资。本轮融资资金将用于公司产品的商业化加速、新产品研发、临床注册,进一步完善血管介入诊疗的全球化布局。

博动医学2015年9月成立于上海,由行业资深管理团队和全球顶尖科学家共同创办,致力于成为全球血管介入诊疗的行业领导者。公司产品覆盖血管疾病精准筛查、术中诊断与手术规划、术后疗效评估与患者风险预判等完整血管介入诊疗产业链。截止目前,博动医学拥有70余项中美德日等国专利,具备诸多全球首创顶尖技术。

「恩泽康泰」外泌体+医疗服务

近日,北京恩泽康泰生物 科技 有巧培限公司(恩泽康泰)宣布完成近亿元的A轮融资。融资所得将主要用于公司外泌体治疗中试车间的建设、临床前系列产品研发以及外泌体工程化改造技术平台搭建。

恩泽康泰成立于2017年,该公司是国内首家致力于外泌体技术开发与临床转化的创新型高 科技塌搏 企业,旗下业务板块主要分为:其一,是基于外泌体的创新药研发,主要涵盖肿瘤免疫、罕见病及神经系统疾病等领域;其二,以外泌体为基础的转化医学研究服务,主要与临床专家合作展开科学研究,目前业务已经覆盖全国主要重点城市,已经与国内50多家知名三甲医院和科研单位以及多家精准医学企业建立合作。

「星奕昂生物」开发NK新技术平台和产品

近日,星奕昂生物 科技 有限公司(Neukio Biotherapeutics)宣布完成了4000万美元的天使轮融资。本轮资金将主要用于研发设施建设和通用型现货免疫细胞技术平台和产品的早期开发。

星奕昂创始人,董事长兼首席执行官王立群博士在美国和中国的生物制药领域拥有丰富的专业技术和研发管理经验,曾任复星医药和美国凯特合资公司复星凯特的创始总裁。王立群博士表示:「星奕昂从上海自贸壹号生命科学园区再启程,正在组建核心团队,有信心在通用型细胞治疗领域做出0到1的创新。公司天使轮融资便获得多个著名创新药投资机构的青睐,非常感谢礼来亚洲基金、IDG资本和夏尔巴投资对我们核心团队的能力和技术创新理念的认可和支持。」

「大橡 科技 」类器官芯片领跑者

北京大橡 科技 有限公司(大橡 科技 )近日宣布获得数千万A+轮融资资金支持。大橡 科技 被称为是国内类器官芯片(Organoid-on-a-Chip)领域的先行者。CEO周宇透露,此次融资,除用于加速器官芯片产业链布局外,更将着重推进类器官芯片技术迭代,针对癌症、神经退行性疾病、炎症性疾病等领域的创新药物研发提供高仿生、高通量的模型,同时完善类器官标准化培养体系及在个性化精准医疗领域的应用。

「Ring」专注于基因治疗

近日,Ring Therapeutics完成了1.17亿美元的B轮融资,接下来将通过引入一种全新的基因治疗载体平台来正面应对基因治疗领域的各类挑战。

Ring利用共生病毒组创造了Anellovectors这种由单链DNA环组成的工程载体,一旦使用,将作为附加体保留在细胞核中。这些工程化的指环病毒载体能够将DNA转移到新细胞中,同时不会损害 健康 组织或激活患者的免疫系统。因此,如果有免疫障碍或复发的患者需要再次给药,患者也完全可以进行重复给药,不存在一次性给药的缺陷。

Ring自2017年创立以来,就在着手研究哪些病毒不会引起疾病,从而确定哪些病毒存在于人类体内和人类之间。该公司已经发现了数千种基于指环病毒的候选载体,并有可能在各种疾病中实现基因疗法和核酸药物。此次1.17亿的B轮融资将帮助Ring扩展其载体平台,继续建立其制造能力,以生产用于临床前测试的载体库,并为一项研究提供资金,使公司尽快进入临床。

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