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外泌体如何定量(外泌体定义)

2023-01-19 03:57:01 作者:max
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外泌体多组学14-血浆外泌体不同建库试剂盒和比对方法和稳定性测试

最近在血液中发现的细胞外rna,包括细胞外囊泡(EVs)中的rna,再加上低起始量rna测序的进展,使科学家能够研究它们在人类疾病中的作用。迄今为止,大多数研究都集中在小rna上,而且缺乏优化长rna测量的方法。我们使用血浆RNA评估了六种长RNA测序方法在两个不同位点的性能,并报告了它们在 基因组/转录组的reads(%) 、 检测到的基因数量 、 长RNA转录本多样性 和 可重复性方面 的差异。使用最佳的方法,我们进一步比较了EV和不含EV的RNA血浆中长RNA的谱。

为了系统地比较文库构建试剂盒/条件,我们使用了来自两个独立血浆样本池的总RNA。我们将两个库中的总RNA平均分为6个不同的RNA测序试剂盒/条件,并在两个独立的位点重复构建文库。在样品制备后,我们使用Illumina的HiSeq2500平台进行了长RNA测序,以评估基因组和转录组定位百分比。

在比对之前,从每个样本fq数据中抽取50 million read pairs数据作为后续分析。

在比对到转录组时,我们查看了四种RNA biotypes定量结果:protein-coding, lncRNAs, ncRNAs, and pseudogenes

文章小结:评估指标基因组/转录组的reads(%)、检测到的基因数量、长RNA转录本多样性和可重复性方面的差异

如何用流式细胞仪检测线粒体数量

可以参考

Mattiasson, G. (2004). "Flow cytometric analysis of isolated liver mitochondria to detect changes relevant to cell death." Cytometry A 60(2): 145-154.

最后得到一个相对的半定量

但是问题是,你在分离的过程中会都是大量的线粒体,所以结果是不准的。而且,线粒体也是在不断融合,变化的,是一个动态过程。流式这个方法是无法得到准确数目的。

梯度离心法提取外泌体可以用190000g吗?

可以。梯度离心法提取外泌体可以用190000g,梯度的本意是一个向量(矢量),表示某一函数在该点处的方向导数沿着该方向取得最大值,即函数在该点处沿着该方向(此梯度的方向)变化最快,变化率最大(为该梯度的模)。

最近在关注外泌体?有没有姐妹了解过?

说到外泌体,我做过奥本源的外泌体医美,这个具有高渗透性的优势,能够轻松直达肌底,激活细胞,从而从根源上抚平细纹,延缓衰老。还能促进与诱导胶原蛋白、弹性蛋白的生成,让肌肤更加年轻诱人~⌄

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