间充质细胞marker（间充质细胞和间质细胞）

让我们深入了解间充质细胞marker和间充质细胞和间质细胞之间的知识，以获得更多的帮助!

间充质干细胞有什么作用？

间充质干细胞对许多疾病具有潜在治疗作用，包括多种自身免疫性疾病、移植物抗宿主病、血液病、血管性疾病、糖尿病、组织器官损伤和退行性疾病等。

什么是间充质干细胞？

间充质干细胞是干细胞家族的重要成员，来源于发育早期的中胚层和外胚层，属于多能干细胞，MSC最初在骨髓中发现，因其具有多向分化潜能、造血支持和促进干细胞植入、免疫调控和自我复制等特点而日益受到人们的关注。如间充质干细胞在体内或体外特定的诱导条件下，可分化为脂肪、骨、软骨、肌肉、肌腱、韧带、神经、肝、心肌、内皮等多种组织细胞，连续传代培养和冷冻保存后仍具有多向分化潜能，可作为理想的种子细胞用于衰老和病变引起的组织器官损伤修复。

间充质干细胞是什么？真的能抗衰老吗？

间充质干细胞是一种多能干细胞，它具有干细胞的所有共性，即自我更新和多向分化能力。

在临床应用也最多，与造血干细胞联合应用，可以提高移植的成功率，加速造血重建。

当患者接受大剂量化疗后，将间充质干细胞与造血干细胞一同输入，可明显加速患者血细胞恢复时间，且安全无不良反应。

间充质干细胞不仅存在于骨髓中，也存在于骨骼肌、骨外膜和骨小梁中。

由于它分化的组织类型十分广泛，因此临床应用价值不菲。

什么是间充质干细胞，有什么作用？

人类造血干细胞首先出现于胚龄第2～3周的卵黄囊，在胚胎早期（第2～3月）迁至肝、脾，第5个月又从肝、脾迁至骨髓。在胚胎末期一直到出生后，骨髓成为造血干细胞的主要来源。 间充质干细胞(MSCs)是属于中胚层的一类多能干细胞，主要存在于结缔组织和器官间质中，以骨髓组织中含量最为丰富，由于骨髓是其主要来源，因此统称为骨髓间充质干细胞。 哎，百度百科上也讲不清楚。上面的是那里摘来的。个人认为既然有两个名字，而又各有其定义，那基本上就是不同的了，可以从来源、作用、分化角度区别它们。 建议你找本辞海或者细胞方面的书查查——如果有兴趣的话。

什么叫间充质?

间充质，mesenchyme，在胚胎时期由中胚层细胞分化而来。间充质由间充质细胞和无定型的基质构成。不含纤维。间充质细胞呈星状，细胞间以突起相互连接成细胞网。

细胞核大，核仁明显，细胞质弱嗜碱性。间充质细胞分化程度低，有很强的增殖分化能力。在胚胎时期分化成多种结缔组织细胞、内皮细胞、平滑肌细胞等。

主要特性：

间充质干细胞(MSC)是属于中胚层的一类多能干细胞，主要存在于结缔组织和器官间质中，以骨髓组织中含量最为丰富，由于骨髓是其主要来源，因此统称为骨髓间充质干细胞。骨髓间充质干细胞具有以下特性：

一、具有强大的增殖能力和多向分化潜能，在适宜的体内或体外环境下具有分化为肌细胞、肝细胞、成骨细胞、脂肪细胞、软骨细胞、基质细胞等多种细胞的能力。

二、具有免疫调节功能，通过细胞间的相互作用及产生细胞因子抑制T细胞的增殖及其免疫反应 ，从而发挥免疫重建的功能。

三、具有来源方便，易于分离、培养、扩增和纯化，多次传代扩增后仍具有干细胞特性，不存在免疫排斥的特性。

四、面目模糊，表面抗原不明显，异体移植排异较轻，配型要求不严格。

正是由于间充质干细胞所具备的这些免疫学特性，使其在血液病治疗方面具有广阔的临床应用前景。通过自体移植可以重建组织器官的结构和功能，并且可避免免疫排斥反应。

Cell | 单细胞转录组揭示肝实质细胞及肺实质细胞的早期细胞谱系

Cell | 单细胞转录组揭示肝实质细胞及肺实质细胞的早期细胞谱系

原文题目：Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Emergence of Liver Parenchymal and Nonparenchymal Cell Lineages

发表时间：2020年10月

影响因子：38.6

摘要：加拿大特里福克斯实验室一团队，揭示单细胞转录组学揭示了肝实质和非实质细胞谱系的早期出现。

早期肝脏的细胞复杂性和规模限制了对其器官形成过程中出现的分析。为了解决这些问题，作者分析了从胚胎E7.5天到E10.5天的45334个单细胞转录组数据。该研究的数据详细说明了血管内皮和血窦内皮的差异，包括E8.75天的血窦内皮独特转录谱。该研究描述了两种不同的间皮细胞类型以及早期肝星状细胞，并揭示了这些细胞群的不同时空分布。该研究捕获了肝母细胞特异性和迁移的转录谱，包括肝充质细胞类型的出现和肝母细胞集体迁移的证据。

建库及测序平台：10X Genomics，hromium Single Cell 30 Reagent v2 Chemistry Kit，Illumina Novaseq 6000 system

数据质控：Cell Ranger version 2.1.0

降维聚类、基因表达，差异基因分析等：scran、scater、Seurat

去批次：MNN，Harmony

细胞通讯分析：CellphoneDB、NicheNet（深入解析细胞中的基因表达是如何被相互作用的细胞所调节的）

1.在肝发生中的细胞图谱

作者分析了从胚胎发生第7.5天到第10.5天的内胚层及肝组织。为了富集实质性和非实质性肝细胞，E7.5和E8.75的内胚层、中胚层，E9.5和E10.5的肝芽通过细胞分选进行了剔除。质控后获得了45334个细胞（15个样本），细胞表达中位值为4190个基因。通过聚类获得15个亚群，并通过鉴定marker基因对其进行了注释，包括内胚层、间充质细胞，内皮细胞系和造血细胞等。细胞注释用先前发表的文章进行了验证。

为了更清楚地了解肝细胞类型的产生，作者进一步对内胚层、间充质干细胞和内皮细胞系分别进行了研究。这些细胞系单独进行了可视化，使用Palantir包进一步分析，在发育层面重建细胞系的关系。

2.肝窦和血管内皮细胞在E9.5由共同的内皮祖细胞分化而来

该研究分析了从E7.5到E10.5的2,066个内皮细胞和造血细胞的转录组。聚类后得到4个亚群，分别为血管母细胞、造血祖细胞、内皮细胞和肝窦内皮细胞（HSECs）。

为了详细说明造血细胞和来自血管母细胞的内皮细胞谱系之间的差异，作者使用Palantir包进行了拟时序分析来查看他们潜在的发展进化关系。

作者选择实心箭头处为起始点，选择了空心箭头处为三个终末状态，并计算了到达这些末端状态时每个轨迹的分化潜能和基因表达趋势。分化潜能在血管母细胞簇内最高；然而，内皮细胞和HSEC簇之间存在局部最大值，这表明HSEC中存在第二个cell fate decision（B黑色箭头）。通过对不同细胞类型特性相关的调节因子基因表达的分析，作者阐述了四种细胞类型间的分化发展。

3.早期肝脏中，横隔和肝间充质细胞的异质性

关于间充质（包括STM、间皮和肝星状细胞）的研究不多。因此，对于在早期肝脏中涌现的间充质细胞群体的多样性了解甚少。该研究从E8.75、E9.5和E10.5中计算分离了3691个肝间充质细胞，并基于聚类和差异基因表达分析鉴定了5个不同的亚群。对每个细胞群进行的单独描述和研究，部分用免疫荧光进行了验证。

（包括每个亚群特异性表达的基因，来自哪一个时间的组织，免疫荧光验证时处于组织的什么位置等）

4.早期肝脏中存在肝充质杂交祖细胞

胚胎肝形成于后腹前肠内胚层，它迁移侵入STM。为了探究这一转变，该研究计算分离了从E7.5到E10.5测序的2332个肝祖细胞，并使用聚类和差异表达分析来识别四种不同的细胞状态。

与第三部分研究类似，作者阐述了每个细胞亚群的特异性基因表达，相关的功能，时期来源等。

为了探索细胞特性的转变，作者计算了肝脏、间充质细胞和上皮细胞特异性基因平均值表达谱（图C）。根据对上皮和间充质基因谱结果的分析，早期肝实质内存在一种上皮-间充质混合祖细胞类型，表达与肝间质和肝间充质特性相关的基因。

5.肝母细胞和肝间充质通过不同的迁移机制出现

作者用Palantir推测两种细胞的分化轨迹，根据不同的基因的激活阐述了两种细胞类型不同的迁移机制。

（实心箭头为分化起点内胚层细胞，两个终末状态代表肝母细胞和肝间充质细胞。假时间的基因趋势显示内胚层标记物如Epcam和Foxa1的下调，以及与后前肠特征相关的基因的激活，如Pyy和Onecut1。在这两个实验中，我们看到了与肝细胞迁移相关的基因的激活，包括Hhex和Foxa3，以及肝脏特性，如Hnf4a和Afp（图B）。有趣的是，在肝母细胞终末状态的细胞中，我们看到了Foxa1的重新激活以及与肝脏特性相关的基因的维持；然而，在肝间充质轨迹中，我们没有看到它们的持续表达（图B）。相反，与上皮-间充质转化（EMT）相关的基因，如Snai1、Snai2和Zeb2被激活（图B）。）

6.原始血窦的信号通路

为了探究在血窦生成过程中的胞间相互作用，该研究用CellPhoneDB来确认endothelial, HSEC, hepatoblast,HSC, 和hepatomesenchymal lineages间潜在的通路。

正如预期的那样，作者看到明显的血管内皮生长因子信号，以及肝母细胞和HSC之间的PDGF信号（图A）。接下来，作者对于各种已经发表的和新发现的信号通路进行了细致的描述，阐述了其已知和预测的功能和作用。

原文：

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